Logiciel de facturation électronique : quel outil choisir en 2026 ?

Un logiciel de facturation électronique est un outil numérique qui permet de créer, émettre, recevoir et archiver des factures dans un format structuré (Factur-X, UBL ou CII), conforme aux exigences légales françaises. À partir du 1er septembre 2026, toutes les entreprises assujetties à la TVA devront obligatoirement passer par une Plateforme Agréée (PA) immatriculée par la DGFiP pour émettre et recevoir leurs factures B2B. Voici notre comparatif des meilleures logiciels du marché.

La facturation électronique obligatoire : le calendrier 2026-2027

La réforme s’applique progressivement selon la taille de l’entreprise. Ne pas respecter ces obligations expose à une amende de 15 € par facture non conforme, plafonnée à 15 000 € par an.

1er septembre 2026 : grandes entreprises et ETI

Obligation de recevoir des factures électroniques pour toutes les entreprises assujetties à la TVA. Obligation d’émettre pour les grandes entreprises (GE) et les entreprises de taille intermédiaire (ETI).

1er septembre 2027 : PME, TPE et micro-entreprises

Obligation d’émettre des factures électroniques pour les PME, TPE et micro-entreprises assujetties à la TVA.

Qu’est-ce qu’une Plateforme Agréée (PA) ?

Une Plateforme Agréée (PA) — anciennement appelée PDP — est une solution privée officiellement immatriculée par la DGFiP, habilitée à transmettre, recevoir et archiver les factures électroniques entre entreprises. Vous devez obligatoirement passer par une PA pour être conforme à la réforme.

Indy est une Plateforme Agréée immatriculée par l’État, vérifiable sur la liste officielle publiée par le gouvernement. Avec Indy, aucun outil supplémentaire à souscrire : vos factures sont émises et reçues légalement, gratuitement, depuis votre compte existant. Pour retrouver la liste des PA, c’est par ici.

Les formats de factures électroniques acceptés

Factur-X

Format hybride PDF + XML, recommandé pour les indépendants et TPE. La facture est lisible visuellement et traitable automatiquement. C’est le format généré automatiquement par Indy.

UBL (Universal Business Language)

Format XML pur, courant dans les échanges inter-entreprises et les structures avec ERP.

CII (Cross Industry Invoice)

Format XML de la norme ISO, utilisé principalement dans les secteurs industriels.

Comparatif des meilleurs logiciels de facturation électronique en 2026

Pour choisir, vérifiez en priorité que le logiciel est bien immatriculé comme Plateforme Agréée par la DGFiP, qu’il prend en charge le format Factur-X, et qu’il correspond à votre statut juridique.

Comment choisir un logiciel de facturation électronique ?

De nombreux éléments seront à prendre en considération au moment de sélectionner votre logiciel de facturation électronique.

• Les fonctionnalités de la plateforme : souhaitez-vous uniquement effectuer vos factures sur ce logiciel ou souhaitez vous pouvoir gérer plusieurs aspects, notamment la comptabilité de votre SARL, de votre EI ou encore de votre micro-entreprise ? Autrement dit, quelle est la valeur ajoutée de la solution ?
• La fiabilité : nous vous invitons à bien vous assurer de la fiabilité technique de la plateforme. Il est également nécessaire que la transmission de vos données soit sécurisée. Enfin, l’immatriculation comme plateforme partenaire de l’État vous permettra d’affiner votre choix ;
• Le prix : nous vous invitons à vous tourner vers le logiciel avec le meilleur rapport qualités-fonctionnalités-prix. Ainsi, les solutions intégrant la facturation dans leur offre de base, sont à privilégier ;
• L’accompagnement : vous pourriez avoir des interrogations au sujet de la facturation, il faudra donc privilégier les solutions proposant un service client réactif.

Les meilleurs logiciels de facturation électronique pour les indépendants

Tous les logiciels ci-dessous sont immatriculés comme Plateformes Agréées par la DGFiP. Voici le détail de chaque solution.

Indy

Les fonctionnalités

• 🧾 Un module facturation 100% gratuit : créez et personnalisez toutes vos factures en quelques clics au format Factur-X ;
• 👩🏽‍💼 Gestion de toutes vos déclarations obligatoires, transmises directement à l’administration fiscale ;
• 📊 Pilotage de votre activité : suivez dépenses et recettes grâce à un tableau de bord complet ;
• 📞 Service client 5 étoiles disponible par chat ou par mail ;
• 🏦 Compte pro gratuit et sans frais cachés.

Pour qui ?

Indy accompagne les professions libérales en BNC, les entreprises individuelles (micro ou réel), ainsi que les indépendants en SAS, SASU, EURL et SARL soumis à l’impôt sur les sociétés.

Le prix

• Offre gratuite : facturation illimitée, synchronisation bancaire, comptabilité automatisée ;
• Offres payantes à partir de 12€ HT/mois selon votre statut.

Tiime

Les fonctionnalités

• Création et envoi de factures électroniques au format Factur-X ;
• Hébergement des données en France ;
• Interface simple, pensée pour les indépendants et TPE.

Pour qui ?

Indépendants et TPE cherchant une solution simple et gratuite.

Le prix

Offre gratuite disponible, incluant la conformité à la réforme de facturation électronique.

Pennylane

Les fonctionnalités

• Gestion des justificatifs : photographiez et importez directement dans l’outil ;
• Suivi des factures avec tableau de bord, relances automatiques et rapprochement des paiements ;
• Pilotage de l’activité avec suivi prévisionnel.

Pour qui ?

Indépendants, TPE, PME et start-up avec des besoins comptables avancés.

Le prix

• 14 € HT/mois : facturation, synchronisation bancaire ;
• 24 € HT/mois : + relances automatiques, plan de trésorerie ;
• 49 € HT/mois : + documents comptables et accompagnement personnalisé.

Abby

Les fonctionnalités

• Module facturation illimité, conforme Factur-X ;
• Suivi de trésorerie en temps réel ;
• Déclaration du chiffre d’affaires avec connexion à l’URSSAF.

Pour qui ?

Principalement les auto-entrepreneurs et micro-entrepreneurs.

Le prix

• Offre gratuite : facturation illimitée, comptabilité conforme ;
• 9 € HT/mois : + documents personnalisés, rappels Urssaf ;
• 15 € HT/mois : + synchronisation bancaire, relances impayés, gestion TVA.

Vous avez la moindre interrogation au sujet de la facturation électronique, des logiciels de factures et devis pour le BTP ou même sur les logiciels de comptabilité en ligne ? Nous sommes là pour vous éclairer ! 💡