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Tout savoir sur la comptabilité des kinésithérapeutes libéraux
Découvrez tout ce qu’il faut savoir sur la comptabilité des kinésithérapeutes en libéral : obligations et spécificités comptables, cotisations sociales, TVA.. mais aussi salaire moyen et statut juridique possible.

Le kiné, ou masseur-kinésithérapeute, est un professionnel paramédical qui travaille main dans la main avec les médecins. Après une opération, il agit manuellement ou avec l’aide de machine pour rééduquer le corps. Le kiné utilise le massage, l’électro-physiothérapie et des exercices ciblés pour réapprendre aux patients à marcher, bouger les doigts, retrouver une sensibilité motrice ou encore éliminer une douleur liée à une mauvaise posture. Il agit donc sur les troubles de l’appareil locomoteur, respiratoire, cardiovasculaire, digestif et génito-urinaire.
Non. En plus de la rééducation, le kinésithérapeute joue un rôle important de prévention, que ce soit auprès des sportifs de haut niveau pour éviter les blessures ou auprès du grand public pour corriger des postures néfastes. Grâce aux manipulations du corps, le kinésithérapeute agit sur les fonctions motrices pour que le patient retrouve toute sa mobilité et le fonctionnement normal de son organisme. Le kiné peut se spécialiser dans certaines pratiques, comme le sport ou la thalassothérapie qui utilise les bienfaits de l’eau dans la rééducation.
En France, l’exercice de la profession de masseur-kinésithérapeute se fait majoritairement en libéral (80%). Mais il existe plusieurs possibilités de pratique comme le remplacement, l’assistanat, ouvrir un cabinet médical seul ou en association avec d’autres praticiens par exemple.

Si vous exercez votre activité de kiné en libéral en entreprise individuelle, vous devez obligatoirement tenir une comptabilité de trésorerie et répondre aux différentes exigences comptables et fiscales de l’administration française. La comptabilité BNC de trésorerie est simple, mais peut très vite devenir un facteur de stress et d’épuisement. De plus, il faut régulièrement enregistrer les encaissements et décaissements ce qui entraîne une perte de temps si cela n’est pas automatisé.
Vous pouvez choisir le régime micro-BNC dans le cas où vos recettes annuelles sont en dessous de 77 700 € ou pendant vos deux premières années d’exercice. Votre bénéfice imposable sera donc calculé après application d’une déduction forfaitaire pour frais professionnels de 34%. Votre déclaration fiscale se fait alors uniquement sur la 2042-C-PRO et vous n’avez pas à remplir de déclaration 2035. C’est un régime dont vous pouvez tirer avantage si vous avez une activité avec très peu de charges réelles, pour une première année d’activité par exemple.
Les professionnels qualifiés pour le micro-BNC peuvent y renoncer si la déclaration contrôlée leur est plus avantageuse (dépenses professionnelles supérieures à 34%, dispositif ZRR, etc..). Dans tous les cas, le régime de la déclaration contrôlée devient obligatoire pour les kinés en libéral à partir du moment où vos recettes sont supérieures à 77 700 € 2 années consécutives. En dessous de ce seuil, la déclaration contrôlée est facultative. Sous ce régime, vous devez remplir une déclaration fiscale 2035.

Vous pouvez choisir entre plusieurs statuts juridiques selon votre situation. L’Entreprise Individuelle (EI) bénéficie de démarches administratives allégées. C’est un statut idéal si vous exercez votre activité de kinésithérapie en nom propre. À l'inverse la société permet de vous associer avec d’autres praticiens, de mieux structurer votre activité et parfois d’optimiser votre fiscalité. Les formes les plus courantes sont la SELARL, la SELAS ou encore la SCP.
La Société Civile de Moyen (SCM) est utilisée par de nombreux masseurs-kinésithérapeutes qui souhaitent réduire leurs coûts de fonctionnement tout en restant indépendants. La SCM permet de mettre en commun du matériel, des locaux ou du personnel (secrétariat par exemple) avec d’autres praticiens. Ce partage de coûts fixes est fortement apprécié en tant que kiné indépendant. Les associés à la SCM peuvent très bien exercer une autre profession libérale que kinésithérapeute.
La Société Civile Professionnelle (SCP) permet aussi d’exercer votre activité en commun avec d’autres praticiens. Ce statut implique le partage des coûts de la clientèle et vous êtes dans l’obligation de vous associer à d’autres masseurs-kinésithérapeutes.
La Société d’Exercice Libéral (SEL) est intéressante si vous exercez avec d’autres confrères kinésithérapeutes ou professions libérales. Ce statut permet de partager les frais entre associés et limite la contribution aux pertes en fonction des apports de chacun. La forme privilégiée est la SELARL (Société d’Exercice Libéral à Responsabilité Limitée).

Pour le règlement des cotisations sociales et d’assurance maladie, les masseurs-kinésithérapeutes sont rattachés à l’URSSAF. Les kinés conventionnés dépendent de la Caisse Primaire d’Assurance Maladie (CPAM) mais le paiement se fait toujours auprès de l’URSSAF. Pour ce qui est du régime de retraite et d’invalidité, les masseurs-kinésithérapeutes sont affectés à la caisse CARPIMKO.
Pour les kinésithérapeutes exerçant en sociétés libérales de type SEL ou SELARL, vous êtes soumis à l’impôt sur les sociétés (IS). Vos bénéfices sont imposés à 15 % jusqu’à 42 500 €, puis au taux normal de 25 % au-delà de ce montant. Les kinésithérapeutes relevant de l’IS sont également tenus d’établir des comptes annuels et de déposer une déclaration fiscale adaptée (liasse fiscale).
Un kinésithérapeute libéral n’est pas redevable de la TVA pour ses actes médicaux et paramédicaux, qui sont exonérés en vertu de l’article 261 du Code général des impôts. Mais attention : certaines prestations accessoires non médicales peuvent être soumises à la TVA.

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En 2025, le salaire moyen d’un kinésithérapeute libéral en France se situe entre 2 500 et 4 500 € net par mois. Il varie selon l’expérience, la localisation, les charges et le volume de patients.