Nouveau : Indy lance l’option expert-comptable  En savoir plus

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour EURL ?

Quel que soit votre statut juridique, tenir une comptabilité rigoureuse est primordial. En effet, une bonne tenue comptable permet non seulement de mieux gérer la trésorerie de votre entreprise mais également d’être en conformité avec les exigences de l’administration fiscale. Aujourd’hui, nous allons nous pencher sur le cas des EURL (Entreprises Unipersonnelles à Responsabilité Limitée) et vous présenter le comparatif des meilleurs logiciels pour tenir une comptabilité en ligne en EURL en 2025.

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour EURL ?

📝 En résumé :

  • Parmi les meilleurs logiciels de comptabilité pour EURL, nous retrouvons Indy, Pennylane, Sage 50 et Macompta.fr. Tous proposent une large gamme de fonctionnalités, dont un outil de facturation. Toutefois, le logiciel de comptabilité le moins cher reste Indy ;
  • En choisissant un logiciel de comptabilité pour EURL, vous avez la possibilité de tenir une comptabilité plus rapide, plus sûre et à prix mini ;
  • Pour choisir le logiciel de comptabilité qui correspond à vos besoins, vous devez étudier plusieurs critères : les fonctionnalités proposées, l’ergonomie de l’interface, les prix pratiqués et les avis clients.

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Le comparatif 2025 des meilleurs logiciels de comptabilité pour EURL

1. Indy

Indy, c’est un logiciel de comptabilité français conçu à destination des travailleurs indépendants. Que vous soyez en micro-entreprise (ou auto-entreprise), en entreprise individuelle (EI) ou en société (SARL, EURL, SASU, SAS), nous sommes là pour vous accompagner !

L’objectif d’Indy ? Vous fournir une application intuitive pour que vous puissiez être le plus autonome possible. Si vous avez besoin de conseils ou d’assistance, un service client aux petits soins est à votre disposition pour vous aider.

Niveau fonctionnalités, Indy propose :

  • La synchronisation sécurisée de vos opérations bancaires. Vos transactions sont catégorisées automatiquement dans les bons comptes comptables ;
  • La gestion des justificatifs et notes de frais. Sur l’application Indy, vous avez la possibilité de conserver tous vos documents et justificatifs (via une simple photo) tout en préservant leur valeur probante ;
  • Le pilotage de votre activité en temps réel avec des tableaux de bord intuitifs ;
  • Un module de facturation pour créer et personnaliser des devis et des factures ;
  • L’édition automatique et l’envoi de vos déclarations fiscales obligatoires : déclaration annuelle de revenus, déclaration 2033, déclaration 2065 ;
  • Le pré-remplissage des documents comptables : grand livre, livre journal, comptes annuels (bilan comptable, compte de résultat, annexe) ;
  • Une aide à la création d’entreprise avec un guide détaillé des étapes à suivre et un accompagnement assuré par nos experts ;
  • Un compte pro 100 % gratuit et sans frais de tenue de compte avec IBAN français, carte Mastercard, virements illimités et instantanés, etc. ;
  • … Le tout dès 49 € hors taxes (HT) par mois !

Notez également qu’Indy propose la formule Essentiel au tarif imbattable de 0 € par mois. Cette formule comprend de nombreuses fonctionnalités, à l’exclusion de l’édition des documents comptables et déclarations fiscales.

2. Pennylane

Pennylane est un logiciel français de gestion financière. Il gère les achats, les ventes, le flux de trésorerie, la facturation et la comptabilité. Il s’adresse aux indépendants dont les EURL, aux TPE (Très petites entreprises), aux PME (Petites et moyennes entreprises) et aux ETI (Entreprises de taille intermédiaire).

Il propose un large choix de fonctionnalités avec :

  • Un outil de facturation en ligne EURL pour éditer vos devis puis les transformer en factures ;
  • La gestion des factures clients et fournisseurs avec tableaux de bord intuitifs ;
  • L’automatisation des relances pour ne pas accumuler les impayés ;
  • La gestion des justificatifs et notes de frais en les intégrant dans l’outil ;
  • La synchronisation bancaire et la catégorisation automatique des transactions ;
  • L’édition des déclarations fiscales et documents comptables obligatoires ;
  • Un compte pro avec cartes physiques et virtuelles Mastercard.

Pennylane propose 3 options tarifaires :

  • La formule Starter à 7 € HT par mois ;
  • La formule Basique au prix de 14 € HT par mois ;
  • La formule Essentiel à 24 € HT par mois ;
  • La formule Premium + module comptable à 79 € HT par mois (recommandé uniquement aux comptables).

3. Sage

Sage 50 Compta (ex-Ciel Compta) est un logiciel de comptabilité conçu pour les petites, moyennes, grandes entreprises et indépendants (EURL, SARL…). Il permet de simplifier la saisie des écritures comptables, de gérer les déclarations sociales et de suivre la trésorerie.

Plus précisément, il offre des fonctionnalités diverses telles que :

  • Une saisie des écritures simplifiée et guidée ;
  • Un accès à votre trésorerie prévisionnelle. Vous avez une vue globale de votre budget afin de pouvoir le maîtriser ;
  • Un tableau de bord pour une analyse poussée. Vous pouvez accéder à de nombreux tableaux de bord, bilans et comptes de résultat préparatoires afin d’avoir une vision d’ensemble de la comptabilité de sa société.

Pour satisfaire vos besoins, 3 formules sont disponibles :

  • La formule Pack Essentials dès 19 € HT par mois ;
  • La formule Pack Standard à partir de 36,80 € HT par mois ;
  • La formule Pack Premium à partir de 63,20 € HT par mois.

4. Macompta.fr

Enfin, Macompta.fr est un logiciel de compta qui s’adresse aux entrepreneurs, quel que soit leur statut juridique (EURL, SASU, auto-entrepreneur, etc.) et aux associations.

Il couvre un grand nombre de fonctionnalités dont :

  • La création et personnalisation des devis et factures ;
  • L’enregistrement des justificatifs et notes de frais ;
  • La gestion des indemnités kilométriques (IK) ;
  • La gestion des salariés, des contrats et bulletins de paie ;
  • Le suivi des immobilisations et calcul des amortissements ;
  • Le remplissage et envoi des déclarations de TVA et liasse fiscale.

Le prix varie selon l’outil dont vous souhaitez profiter :

  • L’outil Comptabilité : à partir de 6,67 € HT par mois ;
  • L’outil Immobilisations : dès 2,50 € HT par mois ;
  • L’outil Déclarations fiscales : à partir de 8,25 € HT par mois ;
  • L’outil Facturation : dès 6,67 € HT par mois ;
  • L’outil Paie : à partir de 24,90 € HT par mois.

Tableau comparatif : Indy, Pennylane, Sage et Macompta.fr

⚙️ CritèresIndyPennylaneSage 50 ComptaMacompta.fr
🎯 Pour qui ?Les indépendants :
– Micro-entreprise ;
– Entreprise individuelle (EI) ;
– Société (EURL, SARL, SASU, SAS)
Tous les indépendants (EURL, SARL…), TPE, PME, ETIPetites, moyennes, grandes entreprises et indépendants (EURL, SARL…)Entrepreneurs (EURL, SASU, auto-entrepreneur, etc.) et associations
🧰 Fonctionnalités
💳 Synchronisation bancaire🟢🟢🟢🟢
🧠 Catégorisation intelligente des transactions🟢🟢Non précisé🟢
📋 Déclarations fiscales🟢🟠 à partir de l’offre Premium🟢🟢
💻 Outil de facturation (devis et factures)🟢🟢🟢🟢
💳 Compte pro🟢🟢🔴🔴
📞 Support client🟢🟢🟢🟢
💰 Prix du logiciel de comptabilité pour EURLÀ partir de 0 €/moisÀ partir de 14 €/moisÀ partir de 19 €/moisPlusieurs outils sont proposés à l’unité :
– Outil Comptabilité : à partir de 6,67 € HT par mois ;
– Outil Immobilisations : dès 2,50 € HT par mois ;
– Outil Déclarations fiscales : à partir de 8,25 € HT par mois ;
– Outil Facturation : dès 6,67 € HT par mois ;
– Outil Paie : à partir de 24,90 € HT par mois

Tableau mis à jour en septembre 2025

Les avantages du logiciel de comptabilité en EURL

🚀 Une comptabilité plus rapide et plus sûre

Les logiciels de comptabilité intègrent aujourd’hui l’intelligence artificielle ce qui permet notamment la synchronisation de votre compte bancaire ainsi que la catégorisation automatique de vos transactions dans les bons comptes comptables. Résultat : vous réduisez considérablement le risque d’erreurs.

Ce système permet d’automatiser et d’optimiser à 100 % la tenue de votre comptabilité :

  • Les déclarations fiscales (2033, 2065, TVA) sont pré-remplies à l’aide de vos données ;
  • Le logiciel vous informe où et quand envoyer ces documents pour éviter les pénalités prévues en cas de retard ou de non-conformité ;
  • Les comptes annuels sont générés automatiquement ;
  • Les déductions applicables à votre situation sont indiquées par le logiciel ;
  • Et si vous avez des questions ou un besoin quelconque, le service client traite votre demande dans les plus brefs délais.

En faisant appel à un expert-comptable, les échanges et les rendez-vous prennent du temps. Opter pour un logiciel de comptabilité en EURL permet d’accélérer les processus, d’accéder à vos documents n’importe où, à n’importe quelle heure de la journée et de conserver une totale autonomie.

💰 Une comptabilité peu onéreuse

Le saviez-vous ? En EURL, vous n’avez pas l’obligation de faire appel aux services d’un expert-comptable ni de faire certifier vos comptes !

Les experts-comptables sont des professions réglementées, ils pratiquent souvent des tarifs très élevés et peu accessibles aux indépendants opérant en EURL.

C’est pourquoi, le logiciel de comptabilité présente une parfaite alternative, à la fois efficace et économique. Un logiciel de compta coûte en moyenne 2 à 5 fois moins cher qu’un expert-comptable.

Comment choisir son logiciel de comptabilité en EURL ?

Aujourd’hui, le marché français regorge de logiciels de comptabilité. Trouver celui qui convient à vos besoins n’est donc pas toujours chose facile. Vous trouverez ci-dessous nos meilleurs conseils et astuces pour y parvenir.

🧰 Comparez les fonctionnalités

Tout d’abord, pour choisir votre logiciel de comptabilité, vous devez comparer les fonctionnalités proposées. Afin de faire un choix éclairé, nous vous recommandons de consulter entre 5 et 10 logiciels de comptabilité.

Pour votre information, un logiciel de compta pour EURL doit contenir a minima les fonctionnalités suivantes :

  • La synchronisation bancaire et la catégorisation automatique des transactions ;
  • La tenue des comptes annuels : bilan, compte de résultat, annexe comptable ;
  • La production de la liasse fiscale avec les déclarations 2042, 2033, 2065 et TVA ;
  • La télétransmission des déclarations à l’administration fiscale ;
  • La gestion du procès-verbal d’Assemblée Générale (PV d’AG) ;
  • La conservation des justificatifs et notes de frais au sein de l’outil ;
  • La mise à disposition d’un espace documentation (FAQ, blog, etc.).

💻 Comparez l’ergonomie du logiciel

Un logiciel de comptabilité doit également être facile à utiliser, sécurisé et accessible depuis tout appareil et à tout instant. Privilégiez donc une solution ergonomique dotée d’un design épuré pour que vous puissiez réaliser votre comptabilité en quelques clics seulement.

Assurez-vous que votre logiciel de comptabilité respecte les normes obligatoires FEC (Fichier des écritures comptables) et EDI (Échange de données informatisé) afin que vous soyez en conformité avec l’administration fiscale française. Sur economie.gouv.fr, vous disposez d’ailleurs d’un outil de test des fichiers des écritures comptables. Pour y accéder, cliquez sur cette page.

Un entrepreneur en EURL satisfait du logiciel de comptabilité Indy qui dispose de tous les critères importants : ergonomie, fonctionnalités, etc.

💶 Comparez les prix

Comme dit plus haut, les services proposés par un expert-comptable sont en moyenne 2 à 5 fois plus coûteux qu’un logiciel de comptabilité. En effet, alors qu’un expert-comptable coûte en moyenne entre 150 € et 200 € par mois, un logiciel de comptabilité en ligne coûte moins de 100 € par mois.

Pour choisir votre logiciel de comptabilité en EURL, vous devez veiller à ce que l’abonnement inclut l’ensemble des fonctionnalités nécessaires à l’établissement de votre comptabilité tout en pratiquant un prix abordable. Veillez également à ce qu’il ne comporte pas de frais cachés (par exemple pour le téléchargement de la liasse fiscale).

⭐ Comparez les avis clients

Pour choisir votre logiciel de comptabilité, vous pouvez consulter des plateformes comme Trustpilot, Avis Vérifiés… où les clients partagent et notent leurs expériences. Les clients sont en effet les mieux placés pour donner un avis objectif.

Les réseaux sociaux constituent aussi une bonne source d’information : vous pouvez y consulter des retours d’expérience et même échanger directement avec des utilisateurs.

Enfin, le bouche-à-oreille reste encore aujourd’hui l’un des moyens les plus fiables pour trouver le logiciel de comptabilité pour EURL qui correspond vraiment à vos besoins. N’hésitez donc pas à en parler autour de vous et à demander à vos pairs quel outil ils utilisent pour leur propre EURL.

Une question sur le logiciel de comptabilité en EURL ou un avis à nous transmettre ? Laissez-nous un commentaire dans l’espace ci-dessous, l’équipe Indy se fera une joie d’y répondre ! 🤗

Indy : bien plus qu'une app de comptabilité - Créer un compte

par Lauriane Kadri

Lauriane est rédactrice de contenus chez Indy. Elle a la vocation de vous aider à devenir indépendants sur votre comptabilité.

Questions fréquentes

Quel est le coût d'un comptable pour une EURL ?

Pour une EURL, les honoraires d’un comptable varient généralement entre 80 et 150 € HT par mois pour la tenue courante et peuvent aller jusqu’à 1 500-2 500 € HT par an pour une mission complète (bilan, déclarations fiscales et sociales).

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité gratuit pour EURL ?

L'un des meilleurs logiciels de comptabilité gratuits pour EURL est Indy. Il comprend un large choix de fonctionnalités tout en pratiquant des prix attractifs à partir de 0 € par mois.

Peut-on tenir la comptabilité d'une EURL avec Excel ?

Pas tout à fait ! Vous pouvez tenir votre comptabilité à l'aide d'Excel. Cependant, cet outil n'est pas reconnu par l'administration fiscale. Ainsi, pour être aux normes, tournez-vous plutôt vers des logiciels de comptabilité en ligne comme Indy.

Comment tenir la comptabilité d'une EURL ?

En EURL, vous avez l'obligation de tenir le grand livre, le livre journal et les comptes annuels, à savoir le bilan comptable, le compte de résultat et l'annexe comptable.

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