Quel logiciel de comptabilité choisir popour un freelance ?

Être freelance c’est avoir privilégié l’indépendance professionnelle à la stabilité. En tant que freelance vous travaillez de manière autonome en étant votre propre patron. Contrairement à un salarié classique, vous êtes responsables de l’évolution de votre activité ainsi que de vos obligations fiscales et administratives. Quels sont les outils indispensables pour vous faciliter la vie lorsque vous n’êtes pas un expert en comptabilité ? Nous vous comparons les meilleurs logiciels de comptabilité pour un freelance dans cet article 🕵️

Les meilleurs logiciels de comptabilité pour les freelance en 2026

La majeure partie des travailleurs indépendants ne semble avoir la comptabilité comme sujet de prédilection. Vos obligations comptables sont probablement celles que vous redoutez le plus et dont vous vous passerez bien. Toutefois en fonction de votre statut juridique, vous avez des obligations. Pas de panique, aujourd’hui de nombreux outils existent afin de vous faciliter la vie, le tout, sans vous ruiner ! Chaque logiciel à ses particularités, en fonction de vos besoins et de votre statut juridique, certains outils vous permettrons un gain de temps considérables :

• Indy, initialement un logiciel de comptabilité, est le logiciel tout-en-un des indépendants ;
• Pennylane, c’est un logiciel assez complet principalement tourné vers la gestion de votre finance et la facturation ;
• Freebe, c’est une plateforme de facturation qui a développé son offre pour remplir les besoins des micro-entrepreneurs ;
• Abby, est une application pensée pour simplifier la comptabilité des micro-entrepreneurs.

Parmi les logiciels de comptabilité les plus connus, nous retrouvons également : Fizen, Clementine, Keobiz, ma Compta.fr, Sage, Freelancer app ou encore Ciel Compta.

Il existe également des logiciels entièrement gratuits mais aux fonctionnalités comptables plus restreintes. C’est le cas du logiciel de comptabilité gratuit Odoo, qui permet de catégoriser vos transactions bancaires et de piloter votre activité. Le logiciel Comptabilité Oxygène propose lui aussi une offre générale qui inclue le bilan comptable, le compte de résultat et la question de la TVA. Si vous cherchez uniquement à gérer une comptabilité de trésorerie simple, Grisbi propose une interface gratuite.

Indy, le logiciel tout-en-un pour les freelance

Indy est un logiciel de comptabilité créé pour répondre aux besoins des travailleurs indépendants.

Initialement conçus autour de la comptabilité en ligne, nous comptons désormais plus de 300 000 clients qui nous font confiance. Indy propose aujourd’hui de nombreuses autres fonctionnalités : aide à la création d’entreprise, outil de facturation pour les freelances, compte pro, pilotage de votre activité…etc.

🧑‍💻 La plateforme s’adresse à tous les indépendants : micro-entrepreneur, entrepreneur individuel ou en société (SAS, SASU, SARL, EURL…etc).

Piloter votre activité

Vous avez accès à une plateforme 100% en ligne sur laquelle vous pouvez piloter en temps réel et de manière autonome votre activité. Toutes vos transactions bancaires sont automatiquement synchronisées et catégorisées dans les bonnes lignes comptables. La TVA est automatiquement calculée.

Faire tous vos devis et factures

Vous pouvez faire tous vos devis et vos factures, entièrement personnalisables, directement sur la plateforme. Toutes les factures sont 100% conformes aux dernières normes légales. En cas d’impayé, vous recevrez des alertes afin de pouvoir relancer facilement vos clients.

Ouvrir votre compte pro

Le compte pro Indy est 100% gratuit, sans engagement ni frais de tenue de compte. Une carte de paiement Mastercard est incluse ainsi qu’une carte virtuelle compatible avec Google Pay et Apple Pay. Tous vos virements et prélèvements SEPA sont également illimités (et depuis peu instantanés !). Si vous êtes freelance en société, vous pouvez également faire gratuitement votre dépôt de capital sur Indy.

Générer et télétransmettre vos déclarations comptables

Vous pouvez effectuer vos déclarations obligatoires directement sur Indy en vous laissant guider à travers les étapes. Une grande partie d’entre elles, en fonction de votre statut juridique, pourront être télétransmises directement aux impôts. Déclaration de TVA, déclaration 2035, CFE, DAS2, 2042-C-PRO, DSFU : elles sont toutes à générer directement sur Indy ! Lorsque la télétransmission n’est pas possible, Indy vous transmet toutes les informations pour remplir votre déclaration rapidement et sans erreur.

Un service client réactif et professionnel

Nos spécialistes sont là au quotidien pour répondre à vos questions et vous accompagner dans vos démarches en cas de besoin. Ils sont disponibles via chat ou email 5j/7. Un accompagnement par téléphone est prévu pour la création d’entreprise.

…le tout à des tarifs accessibles et transparents !

Nos tarifs varient en fonction de l’offre choisie et de votre statut juridique. L’offre premium pour les micro-entreprise commence à partir de 112€ par mois avec l’abonnement annuel. Celle dédiée aux entreprises individuelles démarre à partir de 22€ par mois. Pour chaque statut juridique une offre gratuite est également proposée. Sur Indy, toutes les fonctionnalités gratuites le sont entièrement, sans limite de nombre ni de durée !

🤩 Bon plan : pour tout abonnement sur Indy, la création d’entreprise est 100% offerte !

Pourquoi prendre un logiciel de comptabilité en freelance ?

Lorsque vous êtes en freelance vous êtes entièrement autonome. Vous n’êtes plus protégé par une convention collective ou un contrat de travail. Votre comptabilité professionnelle n’est plus effectuée par l’expert-comptable de votre entreprise. La responsabilité de gérer votre activité de A à Z vous appartient.

🤔 Le saviez-vous ? Faire appel à un expert-comptable n’est jamais obligatoire !

Vous avez alors plusieurs possibilités : vous pouvez tout d’abord faire votre comptabilité tout seul. De nombreux freelance en auto-entreprise le font car, en effet, leurs obligations comptables sont très simplifiées. Vous pouvez ensuite faire appel à un expert-comptable : vous n’aurez plus rien à faire concernant votre comptabilité. Cependant votre visibilité sur votre activité sera moindre et son coût est très élevé. La troisième solution qui s’offre à vous en tant que freelance est de faire appel à un logiciel de comptabilité. C’est une alternative moins coûteuse qui vous permet d’allier autonomie et accompagnement.

Un gain de temps

Le logiciel de comptabilité puise sa force dans l’automatisation d’un grand nombre de démarches. Le but : simplifier les démarches et vous faire gagner du temps. Faire votre comptabilité en autonomie peut s’avérer long et fastidieux. Si vous faites appel à un expert-comptable, vous externaliser l’entièreté de vos taches comptables mais uniquement celles-ci. Le logiciel vous propose de traiter vous-même rapidement toutes vos taches : devis et factures, calcul automatique de la TVA, notes de frais par photo, vos déclarations en suivant des étapes…etc.

Le respect de vos obligations légales

Les logiciels de comptabilité sont constamment mis à jour sur les nouvelles obligations légales, les changements de législation, les normes de sécurité…etc. En vous inscrivant, vous êtes sûr de ne pas passer à côté d’obligations comptables complexes, surtout en entreprise individuelle et en société (SAS, SASU, SARL, EURL) dont vous pourriez oublier l’existence. De nombreux logiciels fonctionnent avec des systèmes de rappel qui vous notifient toutes les échéances obligatoires.

La sécurisation de vos données

La sécurité est un sujet primordial pour tout logiciel de comptabilité et de facturation, pour les freelance ou tout autre professionnel. Vos données sont protégées selon les dernières normes européennes de sécurité. Sur Indy, toutes vos transactions bancaires qui apparaissent sur le logiciel sont synchronisées grâce à un agrégateur bancaire sécurisé, agréé par la Banque de France.

Tableau comparatif

Voici un comparatif des avantages et inconvénients des différentes solutions possibles pour réaliser votre comptabilité en freelance :

Comment choisir le meilleur logiciel de comptabilité pour un freelance ?

Questionnez-vous sur vos besoins

Quel est votre statut juridique ?

La freelance n’est pas un statut juridique à proprement parler. Cette expression aujourd’hui largement répandue désigne en réalité uniquement le fait de travailler en tant qu’indépendant. Lorsque vous démarrez en freelance vous avez l’obligation de choisir un statut juridique :

• en micro-entreprise (qui est en réalité une entreprise individuelle au régime micro : micro-social et micro-fiscal) ;
• en entreprise individuelle ;
• ou en société (en SASU, en EURL…).

En fonction de votre forme juridique vos obligations comptables seront plus ou moins importantes et vous n’aurez pas les mêmes besoins en termes de logiciel :

👶 En micro : Si vous êtes en micro-entreprise vos obligations comptables sont simplifiées. La déclaration de chiffre d’affaires à l’Urssaf est tout d’abord assez intuitive et beaucoup de freelance en micro la réalise en autonomie. Des fiches sont disponibles sur le site de l’Urssaf : consultez en ici. Le livre des recettes quant à lui c’est un document dans lequel on retrouve de manière chronologique tous vos encaissements. Des informations obligatoires doivent apparaître : date, montant, mode de règlement, montant de la TVA si besoin…etc. La plus value d’un logiciel de comptabilité en ligne est principalement de disposer d’un tableau de bord pour suivre votre activité et de conserver vos justificatifs, le tout en étant accompagné. Il permet également de bénéficier de conseils quant à votre situation : est-ce que c’est plus intéressant pour vous de passer au réel ? D’être assujetti à la TVA ? Quelles sont les aides financières dont vous avez droit ?

🔎 Si vous souhaitez prendre un logiciel de comptabilité en micro, nous vous recommandons d’en choisir un qui vous permet également de faire vos devis et vos factures. C’est le cas de l’offre gratuite Indy ou encore des abonnements proposés par Abby et Freebe.

🧑 En entreprise individuelle : vos obligations sont un peu plus complexes qu’en micro. Le tarif d’un logiciel de comptabilité sera donc également un peu plus élevé, dû aux fonctionnalités supplémentaires nécessaires. La liasse fiscale est ensemble de documents comptables obligatoires qui comprennent le bilan comptable et le compte de résultat. Un logiciel de comptabilité comme Indy vous permettra de générer ces documents sans erreur ! Vous pourrez également déclarer votre TVA , mensuellement, trimestriellement (régime réel normal) ou annuellement (régime réel simplifié) .

🧓 En société : les obligations des sociétés sont complexes et empruntent d’un certain formalisme. Faire votre comptabilité tout seul est fortement déconseillé en raison des nombreuses erreurs qui peuvent survenir. Le logiciel de comptabilité va alors être un allier primordial dans votre quotidien. C’est une alternative plus économique qu’un expert-comptable. À partir de 49€ par mois sur Indy vous pouvez tout d’abord créer votre société, ouvrir un compte pro et y faire votre dépôt de capital. Est également compris votre la télétransmission de la liasse fiscale aux impôts (déclarations 2033 et 2065), votre déclaration de TVA, votre bilan, votre compte de résultat, vos PV d’AG, la DAS2…etc. Si vous êtes en SAS ou en SASU, vous pouvez faire la fiche de paie du dirigeant sur Indy. Tout au long de votre abonnement vous êtes accompagnés et conseillés par nos spécialistes en société.

Si vous êtes soumis à l’impôt sur le revenu (IR) ou à l’impôt sur les sociétés (IS), certains documents peuvent également varier.

Quelle est votre activité ?

En fonction de votre métier vos besoins seront également différents. Si vous êtes développeur web en freelance ou fleuriste vous n’aurez pas besoin des mêmes fonctionnalités. Il existe de nombreuses plateformes en ligne qui peuvent inclure la location d’un terminal de paiement pour les activités commerciales. Les développeurs quant à eux seront plus intéressés par l’intégration d’un module de facturation pour freelance en plus de leur module comptable.

Consultez les avis

Vous cherchez le meilleur logiciel de comptabilité pour votre activité de freelance ? Regardez les avis ! Les clients sont les meilleurs porte-parole d’un logiciel. Ces derniers sont les mieux placés pour vous faire un retour d’expérience constructif et personnalisé. N’hésitez pas à vous renseigner autour de vous si vous connaissez également des indépendants. Vous pouvez également consulter de nombreux avis en ligne : sur Truspilot, Facebook, Google. De nombreux avis sont également disponibles sur l’Apple Store (Apple) ou Play Store (Android).

🙋‍♀️ Notre conseil : de nombreux logiciels proposent des offres sans engagements. Cela vous permet de tester par vous-même un logiciel et de changer au besoin s’il ne vous convient pas !

Faites attention aux frais cachés

Certains logiciels peuvent vous présenter une offre attractive en termes de tarif tout en pratiquant des frais cachés derrière. Il est impératif que vous lisez bien les conditions générales avant de vous engager afin de bien comprendre ce qui est inclus dans votre abonnement. Le but : éviter de devoir payer des frais lorsque vous souhaitez télécharger votre liasse fiscale ou encore télétransmettre votre déclaration de TVA.

😍 Bon à savoir : sur Indy, toutes les fonctionnalités gratuites le sont entièrement, sans limite de durée. Aucuns frais ne vous seront demandés pour télécharger un document : si votre interface le génère, vous pouvez le télécharger. Vous n’avez pas non plus de limite pour l’envoi de vos factures, le nombre de déclaration de TVA effectuées, le nombre de vos virements…etc.

Vous avez davantage de questions sur les logiciels de comptabilité pour les freelance, les SASU ou même les SARL ? N’hésitez pas à utiliser l’espace commentaire, nous vous répondrons avec plaisir ! 🤝