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Top 10 des meilleures plateformes de facturation électronique en 2026

En résumé

  • À partir de 2026-2027, toutes les entreprises assujetties à la TVA devront utiliser une plateforme agréée ou un logiciel habilité pour émettre et recevoir leurs factures électroniques ;
  • Les plateformes agréées (PA) garantissent la traçabilité, l’intégrité et la conformité des factures tout au long de leur cycle de vie ;
  • La réforme vise principalement à simplifier la gestion administrative, réduire la fraude à la TVA et offrir une meilleure visibilité sur l’activité économique des entreprises ;
  • Pour bien choisir sa plateforme, il faut vérifier la conformité réglementaire, l’intégration avec vos outils, les fonctionnalités, la facilité d’utilisation et la tarification ;
  • Parmi les plateformes agréées populaires et adaptées aux indépendants figurent Indy, Qonto, Pennylane, IPaidThat, Yooz, Cegid, Tiime, Sage, Sellsy et Axonaut.

À partir de 2026-2027, toutes les entreprises assujetties à la TVA devront progressivement passer à la facturation électronique, que ce soit via un logiciel habilité ou une plateforme agréée (PA). Face à la réforme qui se profile et à la multiplication des solutions disponibles, choisir la bonne plateforme peut vite devenir complexe. Fonctionnalités, conformité réglementaire, automatisation ou encore simplicité d’utilisation : les critères à prendre en considération sont nombreux. Pour vous aider à y voir plus clair, nous avons sélectionné et comparé pour vous les 10 meilleures plateformes de facturation électronique du marché !

Top 10 des meilleures plateformes de facturation électronique en 2026

C’est officiel : Indy est immatriculée PA 💻
Indy a été immatriculé sous réserve en tant que Plateforme Agréée (PA). Vous pourrez continuer à éditer et à recevoir vos factures gratuitement ! 🎉
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Rappel sur ce qu’est une PA (ex-PDP)

Une Plateforme Agréée (PA), anciennement appelée Plateforme de Dématérialisation Partenaire (PDP), est une solution en ligne reconnue par l’administration fiscale pour émettre, recevoir et transmettre des factures électroniques dans le respect des obligations légales. Elle agit comme tiers de confiance entre les entreprises assujetties à la TVA et l’administration.

Concrètement, une Plateforme Agréée (PA) remplit six fonctions essentielles.

1. Elle gère l’émission et la réception des factures

Une plateforme agréée assure l’envoi et la réception des factures électroniques entre fournisseurs et clients, tout en adaptant le format des documents pour qu’ils soient compatibles avec les systèmes des destinataires.

2. Elle transmet les informations fiscales

Une PA extrait et communique à l’administration fiscale certaines données essentielles issues des factures, comme l’identification des parties, le montant hors taxes et la TVA appliquée.

3. Elle réalise le e-reporting

Elle transmet à l’administration les informations sur les transactions qui ne font pas l’objet de factures électroniques.

4. Elle communique les informations de paiement

Elle peut partager les détails relatifs aux paiements pour certaines opérations.

5. Elle vérifie la conformité

Elle contrôle que les factures émises respectent les obligations légales et que les données transmises sont exactes.

6. Elle assure le suivi complet des factures

Enfin, une PA permet de suivre chaque facture tout au long de son cycle de vie, de l’émission à l’archivage, en garantissant traçabilité, intégrité et conformité.

Le saviez-vous ? Passer du terme PDP à PA ne change rien aux missions de ces plateformes ni aux obligations de facture électronique des entreprises : c’est simplement une mise à jour de leur statut légal.

Quels sont les objectifs de la réforme de la facturation électronique ?

La réforme de la facturation électronique (ou e-invoicing) poursuit quatre objectifs principaux.

1. Renforcer la compétitivité des entreprises

En dématérialisant les factures, les entreprises gagnent en rapidité et en efficacité, ce qui diminue les coûts administratifs et simplifie la gestion quotidienne.

2. Simplifier les obligations déclaratives en matière de TVA

À terme, la réforme permettra de simplifier les déclarations fiscales grâce à de nouveaux services, comme le pré-remplissage automatique des déclarations de TVA.

3. Renforcer la lutte contre la fraude à la TVA

Le suivi électronique des factures permet de détecter plus facilement les anomalies et de protéger les entreprises respectueuses des règles.

4. Améliorer la connaissance de l’activité économique et le pilotage des politiques publiques

Enfin, la collecte des données en temps réel offre à l’administration une meilleure visibilité sur l’activité des entreprises et facilite la mise en place de politiques publiques adaptées.

Notre top 10 des meilleures plateformes de facturation électronique en 2026

1. Indy

Aujourd’hui bien plus qu’une solution de comptabilité en ligne, Indy fait désormais partie de la liste des PA immatriculées sous réserve par l’État.

Cette solution permet de se conformer à la réforme de la facturation électronique, avec prise en charge notamment du format Factur-X.

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesModule de facturation gratuit, simple et intuitif pour travailleurs indépendants et petites entreprises (micro-entreprise, SAS, SARL, EURL…).
 
Création, personnalisation et envoi de devis et factures, transformation des devis en factures, génération de factures d’acompte et suivi des encaissements en temps réel.
 
Relance automatique pour ne plus courir après les paiements et obtenir une vision claire de votre trésorerie.
TarifsFacturation électronique incluse sans surcoût dans le module de facturation gratuit Indy.
Avis clients (Trustpilot)4.8/5 pour près de 11 000 avis.

🎉 Et surprise ! Création d’entreprise, gestion comptable, compte pro et optimisation financière… avec Indy, nous vous accompagnons même au-delà de votre facturation !

2. Qonto

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesCréation, envoi, réception et suivi des factures dans une interface unique, personnalisation des factures (couleurs, logo, conditions de paiement), rapprochement des factures et transactions et suivi en temps réel des encaissements.
TarifsFacturation électronique inclus sans surcoût avec les offres Qonto, à partir d’environ 9 € HT/mois selon le forfait bancaire.
Avis clients (Trustpilot)4.8/5 pour près de 49 000 avis.

Ce qui distingue Qonto : il centralise en une seule solution la gestion des paiements, la facturation et la comptabilité.

3. Pennylane

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesCréation, envoi et réception de factures électroniques conformes à la réforme 2026, rapprochement des factures et encaissements, automatisation de l’e-reporting TVA et collaboration possible avec votre expert-comptable.
TarifsFacturation électronique inclus sans surcoût pour les clients Pennylane.
À partir d’environ 14 € HT/mois pour les offres de base, avec des formules plus complètes pour les besoins avancés et le suivi comptable.
Avis clients (Trustpilot)4.5/5 pour 637 avis.

Ce qui distingue Pennylane : c’est une solution tout-en-un qui lie facturation, comptabilité et trésorerie, idéale pour automatiser et centraliser la gestion financière.

4. IPaidThat

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesRéception et émission de factures électroniques conformes, suivi des statuts en temps réel, e‑reporting, rapprochement bancaire, gestion des notes de frais, suivi des paiements et encaissements.
TarifsPlans progressifs adaptés aux TPE/PME (~59 € à ~249 € HT/mois), avec essai gratuit.
Avis clients (Trustpilot)4.1/5 pour 70 avis.

Ce qui distingue IPaidThat : il combine facturation électronique et gestion financière, intéressant pour automatiser plusieurs tâches en même temps.

5. Yooz

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesAutomatisation du traitement des factures fournisseurs et digitalisation des flux.
TarifsDisponibles sur demande, à partir de 99 € par mois. Adaptés aux structures de taille moyenne ou aux besoins avancés.
Avis clients (Trustpilot)Indisponible.

Ce qui distingue Yooz : il est particulièrement apprécié pour l’automatisation des factures fournisseurs plutôt que la facturation client.

6. Cegid

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesÉmission et réception de factures électroniques conformes, e-reporting, automatisation des tâches liées aux factures (émission, réception, TVA) et accompagnement (supports, experts, webinars).
TarifsLa plateforme agréée Cegid est incluse sans frais additionnels. Le tarif dépend des modules choisis.
Avis clients (Trustpilot)3.5/5 pour 326 avis.

Ce qui distingue Cegid : il couvre un large panel de besoins, pertinent pour centraliser toute la gestion d’entreprise.

7. Tiime

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesCréation et envoi de factures électroniques, personnalisation des documents (logo, couleurs), remplissage automatique de certaines mentions obligatoires, suivi des paiements et transformation des devis en factures.
TarifsÀ partir d’environ 17,99 € HT/mois, version gratuite possible pour les besoins basiques.
Avis clients (Trustpilot)4.8/5 pour 413 avis.

Ce qui distingue Tiime : il est idéal si vous recherchez une solution légère et efficace sans surcharge de fonctionnalités.

8. Sage

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesDématérialisation et facturation électronique dans le cadre de l’ensemble des logiciels de gestion Sage.
TarifsVariables selon les modules et la taille de l’entreprise.
Avis clients (Trustpilot)3.9/5 pour plus de 19 100 avis.

Ce qui distingue Sage : il s’agit d’une solution solide pour les entreprises avec des besoins de gestion étendus.

9. Sellsy

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesEnvoi et réception de factures électroniques, relance automatique, catalogue produit, rapprochement bancaire, gestion des achats et marges.
TarifsÀ partir de 39 € HT par mois et par utilisateur, prix modulables selon les modules choisis.
Avis clients (Trustpilot)4.3/5 pour 152 avis.

Ce qui distingue Sellsy : il combine CRM et facturation, utile pour relier les opérations commerciales à la facturation.

10. Axonaut

CritèresDescriptifs
Fonctionnalités essentiellesCréation de factures électroniques conformes, rapprochement bancaire, rapprochement des dépenses et factures, relance automatique des impayés et CRM léger.
TarifsDès 34,99 € HT par mois et par utilisateur (en cas de paiement pour 3 ans).
Avis clients (Trustpilot)4.7/5 pour 547 avis.

Ce qui distingue Axonaut : il est idéal pour gérer tout le quotidien sans outils complexes.

Comparatif rapide de ces solutions

LogicielFonctionnalitésPrixAvis
IndyFacturation électronique gratuite (devis, factures, acomptes, relances), suivi des encaissements, conformité Factur-X, intégré à un écosystème comptable complet.Inclus sans surcoût (gratuit)✭✭✭✭✭ (env. 11 000 avis)
QontoFacturation intégrée au compte pro, personnalisation des factures, suivi des paiements et rapprochement avec les transactions bancaires.Dès ~9 €/mois✭✭✭✭✭ (env. 49 000 avis)
PennylaneCréation, réception et suivi des factures électroniques, e-reporting TVA, rapprochement des encaissements et collaboration expert-comptable.Dès ~14 €/mois✭✭✭✭☆ (637 avis)
IPaidThatÉmission et réception de factures électroniques, e-reporting, rapprochement bancaire, notes de frais et suivi des paiements.~59 € à ~249 €/mois✭✭✭✭☆ (70 avis)
YoozAutomatisation avancée du traitement des factures fournisseurs et digitalisation des flux achats.Sur demande (dès ~99 €/mois)
CegidÉmission et réception de factures électroniques, e-reporting, automatisation de nombreuses tâches et accompagnement à la conformité.Inclus sans surcoût (tarif variable selon modules)✭✭✭☆☆ (326 avis)
TiimeFacturation électronique simple, devis, personnalisation des documents et suivi des paiements.Dès ~17,99 €/mois✭✭✭✭✭ (413 avis)
SageFacturation électronique intégrée à une suite complète de gestion (compta, finance, paie).Variable selon modules✭✭✭✭☆ (≈ 19 100 avis)
SellsyFacturation électronique liée au CRM, gestion commerciale, relances automatiques, gestion des achats et marges.Dès 39 € HT/mois/utilisateur✭✭✭✭☆ (152 avis)
AxonautFacturation électronique, devis, relances, rapprochement bancaire et CRM léger.Dès 34,99 € HT/mois/utilisateur✭✭✭✭✭ (547 avis)

Les informations présentées dans ce comparatif, ainsi que celles de la section précédente, sont actualisées au 8 janvier 2026 mais peuvent être sujettes à des modifications ultérieures.

Comment choisir sa plateforme de facturation électronique ? Les critères à analyser

Pour choisir votre plateforme agréée, plusieurs critères doivent être étudiés.

Conformité réglementaire

Tout d’abord, vous devez vous assurer que la plateforme est immatriculée auprès de la DGFiP (que ce soit de manière « sous réserve » ou définitive) et vérifier que la solution respecte tous les standards techniques imposés par la réforme, notamment la prise en charge des formats Factur-X, UBL ou CII.

Compatibilité et intégration

La PA doit pouvoir s’intégrer facilement avec vos outils existants (votre ERP, logiciel de comptabilité ou CRM). Une bonne interopérabilité évite les saisies redondantes, réduit les risques d’erreurs et simplifie la gestion quotidienne des flux de facturation.

Fonctionnalités clés

Au-delà de la conformité, vous devez évaluer les fonctionnalités proposées par la plateforme :

  • E-reporting ;
  • Archivage légal des factures ;
  • Tableaux de bord et suivi des flux ;
  • Support client et assistance technique.

Facilité d’utilisation et accompagnement

L’interface de la plateforme doit être intuitive et claire, de sorte à ce que vos équipes puissent s’y familiariser rapidement. Veillez également à ce que le support client soit réactif et accessible pour résoudre les questions ou incidents sans perdre de temps.

Tarification et évolutivité

Autre critère important : la politique tarifaire de la plateforme. Certaines solutions sont gratuites, tandis que d’autres fonctionnent par abonnement mensuel ou annuel. Les coûts doivent être proportionnés à votre volume de factures et à la taille de votre entreprise.

Conseil : assurez-vous que la solution peut s’adapter à la croissance de votre entreprise, que vous soyez actuellement une TPE ou que vous prévoyiez de devenir une PME.

Services complémentaires

Certains services supplémentaires peuvent faire la différence (par exemple : archivage légal sécurisé, tableaux de bord pour vos obligations fiscales, rapports et statistiques pour suivre vos flux de facturation, options de relance et suivi des paiements…).

Les avis clients

Enfin, prenez le temps de consulter les avis de la clientèle sur plusieurs sites comme Trustpilot. Cela vous donnera un premier indicateur et permettra d’orienter un peu votre choix.

Et pour approfondir le sujet, le site officiel France Num met à disposition un article de référence à destination des TPE et PME, présentant les plateformes agréées les plus adaptées à leurs besoins.

D’autres questions concernant les plateformes agréées (PA) ou un avis à nous transmettre ? Laissez-nous un commentaire dans l’espace ci-dessous, l’équipe Indy se fera une joie d’y répondre ! 🤗

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par Lauriane Kadri

Lauriane est rédactrice de contenus chez Indy. Elle a la vocation de vous aider à devenir indépendants sur votre comptabilité.

Questions fréquentes

Quelle plateforme pour la facturation électronique ?

Des solutions comme Indy, Qonto, Pennylane, iPaidThat ou Yooz sont toutes des plateformes agréées, conformes à la réforme, et adaptées aux indépendants.

Est-ce légal de faire des factures sur Excel ?

Oui, vous pouvez émettre des factures sur Excel pour vos clients. En revanche, à partir de 2026, si vous êtes assujetti à la TVA (y compris si vous relevez de la franchise en base ou êtes exonéré de TVA), vous devrez respecter la réforme de facturation électronique. Vos factures devront alors être émises et/ou reçues via une plateforme agréée pour être légalement valides.

Est-ce que ChatGPT peut faire de la comptabilité ?

Non, ChatGPT peut expliquer, générer des modèles ou donner des conseils, mais il ne remplace pas un logiciel comptable ou un expert pour gérer vos comptes et obligations légales.

Quel est le logiciel le plus utilisé par les comptables ?

Cegid et Sage restent parmi les plus populaires en cabinet pour la comptabilité et la facturation électronique.

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