- Stripe est une société de paiement en ligne : elle encaisse vos ventes et prélève une commission sur chaque transaction, à partir de 1,5 % + 0,25 € pour une carte standard européenne ;
- Indy est un logiciel de comptabilité en ligne destiné aux indépendants et aux petites entreprises : facturation, compte pro, comptabilité automatisée et déclarations fiscales, avec une offre gratuite et des abonnements dès 9 € HT/mois ;
- Stripe n’est pas un logiciel de comptabilité : elle n’établit pas et ne télétransmet pas pour vous vos déclarations de TVA, votre liasse fiscale ou votre déclaration URSSAF ;
- Stripe n’est pas non plus une plateforme agréée pour la facturation électronique en France. Indy, de son côté, est une plateforme agréée ;
- Pour un indépendant qui vend en ligne, Indy et Stripe peuvent être utilisés ensemble : Stripe pour les paiements, et Indy pour la gestion et la comptabilité.
Vous encaissez déjà vos clients avec Stripe et vous vous demandez si un logiciel comme Indy fait doublon ? Ou vous lancez votre activité et hésitez entre les deux ? La confusion est fréquente, car les deux outils interviennent à différents moments du cycle de vente : Stripe pour encaisser les paiements, Indy pour gérer la facturation et la comptabilité. Ce comparatif détaille le rôle de chacun, leurs tarifs réels, leur situation face à la réforme de la facturation électronique, et la façon de les faire travailler ensemble.

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Indy et Stripe : deux outils qui ne jouent pas le même rôle
Stripe et Indy n’interviennent pas au même moment : le premier traite le paiement de votre client, le second prend le relais une fois l’argent encaissé, de la facture à la déclaration fiscale.
Stripe, une infrastructure de paiement en ligne
Stripe est un prestataire de services de paiement (PSP) américain d’origine irlandaise. Il permet à une entreprise d’accepter des paiements par carte, prélèvement SEPA ou portefeuille numérique, sur un site internet, une application ou via un lien de paiement. L’argent encaissé arrive sur votre solde Stripe, puis la société le vire périodiquement sur votre compte bancaire, déduction faite de ses commissions.
Stripe propose une multitude de services complémentaires : Billing pour gérer les abonnements, Invoicing pour créer et envoyer des factures, Tax pour calculer les taxes, Radar pour lutter contre la fraude, et Revenue Recognition pour automatiser la comptabilisation des revenus.
C’est un outil très puissant, pensé d’abord pour les sites e-commerce, les SaaS et les plateformes, souvent avec l’aide d’un développeur.
Indy, un logiciel de gestion et de comptabilité en ligne
Indy est un logiciel de comptabilité en ligne destiné aux indépendants et aux petites entreprises : micro-entrepreneurs, professions libérales, entreprises individuelles au réel, sociétés (SAS, SASU, EURL, SARL), SCI, holdings et LMNP. Il réunit la facturation, un compte pro avec IBAN français, la catégorisation automatique des transactions et la génération des déclarations obligatoires : TVA, URSSAF, 2035, liasse fiscale selon votre statut.
Indy permet aussi d’encaisser vos clients : vous pouvez ajouter un lien de paiement à vos factures ou accepter les paiements sans contact avec Tap to Pay.
Tarifs : commissions Stripe contre abonnement Indy
Les deux modèles économiques sont opposés. Stripe se rémunère sur chaque transaction, sans abonnement. Indy fonctionne par abonnement mensuel, avec une offre gratuite, et ne prend pas de commission sur les virements que vous recevez sur votre compte pro.
Les frais Stripe à connaître
Stripe applique une tarification à l’usage, sans frais d’installation ni frais mensuels sur son offre standard. Voici les principaux frais pour une entreprise française :
| Service Stripe | Frais |
| Carte standard de l’Espace économique européen | 1,5 % + 0,25 € |
| Carte premium de l’Espace économique européen | 2,8 % + 0,25 € |
| Carte internationale | 3,15 % + 0,25 €, plus 2 % en cas de conversion de devises |
| Prélèvement SEPA | 0,35 € par prélèvement |
| Paiement en personne (Terminal, carte EEE) | 1,4 % + 0,10 €, plus 0,10 € par autorisation Tap to Pay |
| Stripe Billing (abonnements) | 0,7 % du volume facturé |
| Litige reçu (rétrofacturation) | 20 € par litige |
Ces modules se cumulent. Si vous facturez un abonnement via Stripe Billing et que votre client paie par carte, vous payez à la fois les frais de carte et les 0,7 % de Billing.
Les formules Indy
Indy propose trois formules, dont le prix dépend de votre statut juridique :
- Essentiel : gratuit, avec facturation électronique, compte pro, comptabilité automatisée et devis et factures illimités ;
- Plus : dès 9 € HT/mois, avec relances automatiques, factures récurrentes, signature électronique des devis et suivi des seuils ;
- Premium : 15 € HT/mois pour un micro-entrepreneur, 22 € HT/mois pour une entreprise individuelle, 24 € HT/mois pour une SCI et 49 € HT/mois pour une société, avec génération et télétransmission des déclarations fiscales.
Une option expert-comptable peut être ajoutée à l’offre Premium si vous souhaitez faire valider votre bilan et vos déclarations par un professionnel partenaire.
Ce que fait chaque outil, fonctionnalité par fonctionnalité
Le tableau ci-dessous montre bien que les deux outils se recoupent peu. Là où Stripe excelle, Indy reste volontairement simple, et inversement.
| Fonctionnalité | Indy | Stripe |
| Paiement intégré à un site de e-commerce ou une application | ❌ Non | ✅ Oui, cœur de métier |
| Lien de paiement sur facture | ✅ Oui | ✅ Oui |
| Encaissement par carte sur smartphone | ✅ Tap to Pay | ✅ Tap to Pay (Terminal) |
| Abonnements et facturation à l’usage | Factures récurrentes (Plus) | ✅ Très complet (Billing) |
| Devis | ✅ Oui, avec e-signature | Oui (Quotes, offres avancées) |
| Plateforme agréée pour la facturation électronique | ✅ Oui | ❌ Non |
| Compte pro avec IBAN français et carte | ✅ Oui, dès l’offre gratuite | ❌ Non (solde Stripe) |
| Comptabilité selon le plan comptable français | ✅ Oui, automatisée | ❌ Non |
| Déclarations TVA, URSSAF, 2035, liasse fiscale | ✅ Oui (Premium) | ❌ Non |
| Protection contre la fraude | Standard bancaire | ✅ Radar |
| Connexion comptable directe entre les deux outils | ❌ Non | ❌ Non |
| Support | Conseillers basés en France, spécialistes de la compta | 24 h/24, 7 j/7, orienté technique |
Comment utiliser Indy et Stripe ensemble ?
Le fonctionnement est simple : Stripe encaisse vos clients, puis reverse l’argent sur votre compte bancaire. Indy récupère ces virements grâce à la synchronisation bancaire. Il n’y a pas de synchronisation directe entre Stripe et Indy.
Stripe vous verse un montant net
Le montant versé par Stripe ne correspond pas au montant payé par vos clients. Stripe déduit ses frais et les éventuels remboursements ou litiges, et peut regrouper plusieurs ventes dans un même virement.
Vous devez donc distinguer le montant de vos ventes du montant versé par Stripe.
Quel montant déclarer ?
Votre chiffre d’affaires correspond au montant payé par vos clients, et non au montant net versé par Stripe.
- En micro-entreprise, vous déclarez le montant total encaissé avant déduction des frais Stripe.
- Au régime réel, vous comptabilisez également les frais Stripe comme des charges.
Comment suivre vos ventes dans Indy ?
Pour suivre correctement vos encaissements Stripe :
- connectez à Indy le compte bancaire sur lequel Stripe verse vos fonds ;
- conservez les rapports Stripe pour retrouver le détail des ventes, des frais et des remboursements ;
- rapprochez les virements reçus sur votre compte bancaire avec les opérations enregistrées dans Stripe.
Pour quelques ventes, ce suivi reste simple. Si vous réalisez de nombreuses transactions, les rapports Stripe permettent de retrouver plus facilement le détail des opérations.
Si vous facturez des professionnels, vos factures peuvent être émises depuis Indy, qui prend également en charge les obligations liées à la facturation électronique.
Indy, Stripe ou les deux : la bonne combinaison selon votre profil
Indy seul suffit si…
Vous êtes consultant, développeur, graphiste, artisan, profession libérale ou bailleur, et vos clients vous règlent principalement par virement, ou ponctuellement par carte. Le lien de paiement sur facture et le Tap to Pay d’Indy couvrent vos besoins d’encaissement, sans commission sur les virements et sans outil supplémentaire à paramétrer.
Stripe et Indy ensemble si…
Vous vendez sur un site e-commerce, proposez des formations en ligne, des abonnements ou un logiciel en SaaS. Stripe gère le parcours de paiement automatisé, Indy prend le relais pour la comptabilité, la TVA, les déclarations et la facturation électronique. Pour en savoir plus sur la facturation électronique c’est par ici.
Stripe avec un outil plus lourd si…
Vous dirigez une structure avec des salariés, plusieurs entités, des milliers de transactions par mois dans de nombreuses devises, ou un besoin de reporting aux normes internationales pour des investisseurs. Dans ce cas, Stripe se combine généralement avec un ERP ou un cabinet d’expertise comptable capable de gérer la paie et des montages complexes.
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