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- Indy est un logiciel de comptabilité en ligne pensé pour les indépendants et différentes petites structures, gratuit dès son offre Essentiel, quand Axonaut est un ERP léger destiné aux TPE et PME à partir de 97 € HT/mois pour un utilisateur ;
- Les deux logiciels sont immatriculés Plateforme Agréée par la DGFiP et sont déjà conformes à la réforme de la facturation électronique, entrée en vigueur le 1er septembre 2026 ;
- Axonaut inclut un CRM commercial complet (pipeline, opportunités, historique client) qu’Indy ne propose pas, car ce n’est pas sa cible ;
- Indy va plus loin sur l’automatisation fiscale, avec la télétransmission directe des déclarations (TVA, liasse fiscale), et propose même une option Expert-Comptable pour faire valider son bilan par un professionnel ;
- Pour un indépendant solo sans besoin de gestion commerciale, Indy reste la solution la plus économique et la mieux adaptée.
Vous cherchez un logiciel pour gérer votre activité au quotidien et vous hésitez entre Indy et Axonaut ? Les deux outils sont français. Les deux gèrent la facturation. Et les deux sont conformes à la réforme de la facturation électronique, entrée en vigueur depuis le 1er septembre 2026. Pour autant, ils ne répondent pas du tout au même besoin. L’un cible les indépendants qui veulent piloter leur comptabilité en autonomie. L’autre s’adresse aux petites structures qui ont besoin d’un outil de gestion commerciale complet. Ce comparatif vous aide à identifier lequel correspond réellement à votre situation.
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Indy vs Axonaut : deux publics différents
Avant de comparer les tarifs ou les fonctionnalités en détail, il faut comprendre que ces deux logiciels n’ont pas été conçus pour le même utilisateur.
Cette différence de cible se retrouve ensuite dans les tarifs et les fonctionnalités proposées.
Indy accompagne différents profils d’entrepreneurs et de structures : micro-entrepreneurs, entrepreneurs individuels au réel, professions libérales en BNC, sociétés à l’IS (SAS, SASU, EURL, SARL), SCI, holdings et LMNP.
L’objectif est de permettre à un entrepreneur non-comptable de tenir seul sa comptabilité, grâce à une synchronisation bancaire et une catégorisation automatique des transactions par IA. Il n’y a volontairement ni CRM, ni gestion de pipeline commercial : ce n’est simplement pas le besoin de la cible visée.
Axonaut, à l’inverse, est un ERP léger pensé pour les TPE et PME qui gèrent leur cycle commercial de bout en bout : prospection, devis, facturation, suivi de projet, trésorerie et pré-comptabilité.
C’est un outil multi-utilisateurs, avec CRM intégré et compte pro inclus, taillé pour des structures qui ont déjà une équipe et un portefeuille clients actif à suivre.
En pratique, un consultant indépendant ou un professionnel de santé libéral n’a généralement aucun intérêt à payer pour le CRM d’Axonaut s’il n’a pas de pipeline commercial à gérer. À l’inverse, une agence de plusieurs salariés avec un service commercial actif trouvera Indy insuffisant, puisque l’outil ne couvre pas la gestion commerciale.
Comparatif des tarifs Indy et Axonaut
Le prix est souvent le premier critère de comparaison. Mais il reflète surtout deux modèles économiques très différents plutôt qu’un écart de qualité.
Les tarifs d’Indy
Indy fonctionne avec trois formules, dont le tarif varie selon le statut juridique :
- Essentiel : gratuit, accessible à tous les statuts pris en charge (micro-entreprise, EI, SCI, LMNP, SASU, SAS, EURL, SARL), avec compte pro, facturation électronique et suivi comptable ;
- Plus : à partir de 9 € HT/mois en facturation annuelle, pour la facturation avancée et les relances automatiques ;
- Premium : de 15 € HT/mois pour un micro-entrepreneur jusqu’à 49 € HT/mois pour une société à l’IS, avec génération et télétransmission des déclarations fiscales.
Un professionnel libéral en BNC ou une entreprise individuelle paie généralement autour de 22 € HT/mois pour l’offre complète. Une SCI se situe autour de 24 € HT/mois.
Bon à savoir : Indy propose aussi une option Expert-Comptable, en complément de l’offre Premium. Un expert-comptable partenaire vérifie et valide directement votre bilan ainsi que vos déclarations fiscales avant leur envoi, ce qui vous apporte un regard humain sur votre dossier tout en gardant la main sur votre gestion au quotidien.
Les tarifs d’Axonaut
Chez Axonaut, le fonctionnement est différent : un tarif unique inclut toutes les fonctionnalités (CRM, facturation, comptabilité, trésorerie, RH, projets, compte pro), sans module à débloquer.
Le prix évolue uniquement selon le nombre d’utilisateurs :
- 97 € HT/mois pour 1 utilisateur, sans engagement ;
- +29,99 € HT/mois par utilisateur supplémentaire ;
- des réductions de 40 % à 60 % sont accordées pour un engagement de 1 ou 3 ans.
Un essai gratuit de 15 jours permet de tester l’intégralité des fonctionnalités sans engagement.
| Critère | Indy | Axonaut |
| Tarif d’entrée | Gratuit (offre Essentiel) | 97 € HT/mois (1 utilisateur) |
| Version gratuite | ✅ Oui | ❌ Non |
| Compte pro inclus | ✅ Dès l’offre gratuite | ✅ Inclus dans l’abonnement |
| CRM intégré | ❌ Non | ✅ Oui (pipeline, opportunités) |
| Déclarations fiscales télétransmises | ✅ Oui (offre Premium) | ❌ Non |
| Validation par un expert-comptable | ✅ Oui (option dédiée) | ❌ Non |
| Module RH / projets | ❌ Non | ✅ Oui |
| Public visé | Indépendants, AE, SCI, LMNP, sociétés à l’IS, holdings | TPE, PME (1 à 20 utilisateurs) |
Facturation électronique : conformité PA et Factur-X
Depuis le 1er septembre 2026, la réforme de la facturation électronique entre dans sa première phase. À cette date, toutes les entreprises assujetties à la TVA, quelle que soit leur taille, doivent pouvoir recevoir des factures électroniques par l’intermédiaire d’une plateforme agréée par la DGFiP.
L’obligation d’émettre des factures électroniques et de transmettre les données de e-reporting s’applique à cette même date aux grandes entreprises et aux entreprises de taille intermédiaire (ETI).
Les petites et micro-entreprises bénéficient, quant à elles, d’un délai supplémentaire : elles seront concernées par ces obligations d’émission et de e-reporting à compter du 1er septembre 2027
Sur ce point, Indy et Axonaut sont tous les deux immatriculés comme Plateformes Agréées (PA) par la DGFiP. Les deux solutions prennent également en charge le format Factur-X, qui combine un PDF lisible avec des données structurées au format XML.
Chez Indy, la facturation électronique est intégrée au logiciel et disponible sans surcoût, y compris avec l’offre Essentiel.
Chez Axonaut, elle est également intégrée à l’abonnement existant.
La différence se situe donc surtout dans l’environnement proposé autour de la facture électronique : comptabilité automatisée et déclarations fiscales chez Indy, CRM et gestion commerciale chez Axonaut.
Fonctionnalités : comptabilité, CRM et compte pro
Les deux logiciels couvrent la facturation de base (devis, factures, avoirs, personnalisation). Mais leurs points forts respectifs sont très différents.
Comptabilité automatisée contre pré-comptabilité évoluée
Chez Indy, la synchronisation bancaire est agréée ACPR-Banque de France. L’IA catégorise automatiquement la grande majorité des transactions dans les bons comptes comptables.
La principale distinction reste la télétransmission : Indy est agréé par l’administration fiscale pour transmettre directement la TVA, la liasse fiscale (2035, 2033, 2065 selon le régime fiscal) ou la déclaration de chiffre d’affaires à l’URSSAF, sans passer par un tiers.
Pour ceux qui préfèrent malgré tout un contrôle humain, l’option Expert-Comptable permet de faire relire et valider le bilan et les déclarations par un professionnel avant leur envoi, sans renoncer à l’autonomie offerte par le logiciel de comptabilité en ligne au quotidien.
Chez Axonaut, l’automatisation porte sur le rapprochement bancaire et la reconnaissance de documents (OCR), ce qui permet de saisir les dépenses rapidement.
C’est un outil de pré-comptabilité évoluée qui facilite le travail de votre expert-comptable, mais qui ne remplace pas la télédéclaration directe.
CRM et gestion commerciale : l’avantage Axonaut
C’est ici que les deux outils divergent le plus nettement.
Axonaut dispose d’un CRM complet : gestion des contacts et des entreprises, pipeline d’opportunités, historique des échanges (e-mails, appels, devis, contrats signés) et relances planifiées. Pour une agence ou une société de services avec plusieurs commerciaux, c’est un atout réel.
Indy ne propose pas de CRM au sens commercial du terme. La plateforme offre une base clients liée à la facturation, suffisante pour suivre les impayés et l’historique de paiement, mais pas pour gérer des prospects ou un pipeline de vente.
Pour un développeur, un architecte ou un médecin libéral, cette absence n’est généralement pas un problème.
Compte professionnel intégré
Les deux solutions incluent un compte professionnel avec IBAN français.
Chez Indy, ce compte pro (IBAN, carte Mastercard, virements SEPA illimités) est inclus dès l’offre gratuite, sans frais de tenue de compte.
Chez Axonaut, le compte pro est inclus dans l’abonnement unique, avec des cartes Mastercard personnalisables pour l’ensemble des salariés.
Avis clients : ce que disent les utilisateurs
Sur Trustpilot, Indy affiche une note de 4.8/5 pour plus de 15 000 avis. Les retours reviennent régulièrement sur la simplicité de l’application et le gain de temps sur les déclarations.
Axonaut obtient une note de 4,4/5 sur Trustpilot, avec beaucoup moins d’avis qu’Indy. Les utilisateurs apprécient notamment la richesse de ses fonctionnalités, même si certains trouvent son prix élevé.
Le nombre d’avis reste un critère à prendre en compte : Indy compte parmi les logiciels les plus commentés du secteur en France, ce qui donne un retour d’expérience statistiquement plus solide.
Indy ou Axonaut : pour qui ?
Le critère décisif n’est ni l’interface ni même le prix affiché, mais le périmètre réel de votre activité.
Choisissez Indy si :
- Vous êtes en EI, auto-entrepreneur, libéral, en société, en SCI ou en LMNP et souhaitez automatiser votre comptabilité sans expert-comptable ;
- Votre budget est serré : la version gratuite d’Indy couvre déjà les fonctions essentielles ;
- Vous avez besoin de télédéclarations automatisées (TVA, liasse fiscale) directement depuis votre logiciel, avec la possibilité de faire valider votre bilan par un expert-comptable si vous le souhaitez ;
- Vous êtes seul ou en très petite structure, sans pipeline commercial à gérer.
Choisissez Axonaut si :
- Vous dirigez une TPE ou une PME de plusieurs collaborateurs, avec un besoin de CRM pour gérer vos prospects et clients ;
- Vous souhaitez centraliser devis, facturation, comptabilité, projets et RH dans une seule plateforme ;
- Votre activité implique un suivi commercial actif (relances, pipeline, historique d’interactions) ;
- Vous anticipez la croissance de votre équipe, avec une tarification qui évolue par utilisateur plutôt que par module.
Consultez nos autres comparatifs sur le blog Indy : Indy vs Tiime, Indy vs Henrri, Indy vs Freebe, Indy vs Swapn.
